به گزارش شبکه خبری هزاره سوم آریا نوشت: احتمالا محمدباقر نوبخت وظایف علی یونسی، دستیار ویژه رئیس‌جمهور در امور اقوام و اقلیت‌های دینی و مذهبی را بر عهده می‌گیرد. علی یونسی، در ۹ مهر ۱۳۹۲ طی حکمی از سوی روحانی به عنوان دستیار ویژه رئیس‌جمهور در امور اقوام و اقلیت‌های دینی و مذهبی منصوب شد.
برخی سخنان و اظهارات علی یونسی در چند هفته اخیر با واکنش‌های گسترده‌ای مواجه شده بود. در ۱۴ اردیبهشت ۱۳۹۳، علی یونسی، دستیار ویژه رئیس‌جمهور در امور اقوام و اقلیتها، در پایان سفر دو روزه‌اش به شیراز اظهارات جنجالی مطرح کرد.
او گفته بود « اگر به من باشد، هلال‌احمر را تغییر می‌دهم و شیر و خورشید را جایگزین آن می‌کنم؛ البته برای هلال‌احمر هم احترام قائلم.» این اظهارات موجب شده بود انتقادات فراوانی به رئیس‌جمهور وارد شود.
گویا برخی مشاوره‌ها برای تغییراتی در این بخش از دولت صورت گرفته و محمدباقر نوبخت از گزینه‌های جدی برای انجام وظایف این حوزه است. یونسی در شیراز همچنین گفته بود حکومت بنی‌اسرائیل در زمینه همزیستی به اصلاح‌طلبان نزدیک شده است(!)